Специалисты Минфина считают, что если компания по одному счету-фактуре приобретает товары, то НДС можно принимать к вычету частями в разных кварталах. То есть, например, можно часть суммы принять к вычету в текущем налоговом периоде. А остаток перенести на следующие периоды (письмо Минфина от 09.04.2015 № 03-07-11/20293). А вот раздробить вычет при покупке основного средства или нематериального актива нельзя. Входной НДС в таком случае принимают к вычету полностью на всю сумму.
Но при этом во всех случаях действует общее правило: вычет можно переносить в течение ближайших трех лет на любой следующий квартал.